Az animének rengetek műfaja létezik, hasonlóan a filmekhez léteznek: kaland, akció, romantika, dráma, középkorban játszódó, fantasy, sci-fi, horror, és a felnőtt nézőknek hentai ami a pornográf műfajt takarja.
( Vampire Hunter D (horror) )
A legtöbb anime átmenetet képez több műfaj között, és sokfajta különböző elemet tartalmaz. Így nem meglepő, hogy vannak rajzfilmek, amiknek elég nehéz meghatározni a műfaját, néha nem is sikerül pontosan. Előfordul, hogy egy anime gyerekesnek tűnhet, de mégis a gondolatvitele, az eseménysora nem éppen gyerekeknek való, mert lehet, hogy nem értik nem fogják még fel, hogy mit is akar jelenteni. Előfordulhat, hogy például olyan animét szeretnénk megnézni, ami elsősorban horror mégis van benne akció esetleg romantika. Vannak olyan animék is, amelyeket mikor elkezdünk nézni még nem értjük meg, hogy miért van rajta korhatás, de általában a végére megértjük.